医院的两个区域可以为细菌流动提供最大的机会：隔离病房和手术室。这两个区域都要求严格的持续的和彻底的清洗和消毒。

隔离病房

采取隔离措施的病人要求护工和环境服务人员在对病人护理和彻底清洁的时候严格遵守标准防护标准。所有的体液，分泌物和隔离病人的未受伤的皮肤都被认为是潜在的传染源。

在对隔离病房的彻底消毒中，首要的一步是将使用过的物品装袋以防止人员暴露在污染物下，防止通过空气流通造成环境污染和病原体的接触性传播。

根据维吉尼亚卫生系统大学的传染控制手册，环境服务人员在进行其他工作之前，首先必须穿防护服，带防护手套和防护面具。可以被高温高压消毒的物品和仪器，诸如带铰链的设备，需要被装进牛皮纸袋；透明的塑料袋用于盛放必须使用气体高温高压消毒的仪器，比方说呼吸管路。所有的特殊工序盘的织物必须放在织物盒中；所有被体液这种可视污染物污染的材料必须被处置进常规的医疗废物容器中。所有开口的包装物可处置进常规的垃圾桶中。尖锐物品需要放入用于这种用途的硬质容器中。

被污染的仪器需要用杀菌溶液清洗，冲洗后用纸巾干燥。物品需要摆放进合适的袋中，打上标签并且放置于污染物室。无菌处理部门的工作人员从污染物室取走以上污染物。

虽然微生物可能存在于墙体或者地表面，除非可视污染物，他们很少与感染的传播有关。墙体，百叶窗和窗帘需要定期清洁。如果是传染病人或者隔离病人，根据维吉尼亚卫生系统大学手册，窗帘必须更换。根据规定，环境服务人员必须彻底清洗整个病房。被肠球菌污染的病房的RMW容器必须被清空并且彻底清洗，其他隔离病房的RMW容器在每次倾倒时就不需要清空并用水清洗，除非超过容器容积3/4或者有恶臭。隔离室的地垫被仔细密封在塑料垃圾袋中后，可以被扔掉。如果被体液污染，就需要盛放在污染室中指定的大型RMW容器中而不是垃圾桶中。

根据耶鲁-纽黑文市医院的感染控制手册规定，床架和扶手，床垫以及其他病房内的家具都需要使用环境保护局批准使用的消毒剂来清洗并且遵循生产商使用说明来使用。吸入式容器需要被移除销毁或者再处理，所有其他可以重复使用的器械需基于医疗设施的护理，管理，消毒程序和环境服务规定来灭菌。隔离室中的浴室必须被彻底清洗，特别要清洁洗手盆，马桶和门把手。根据耶鲁-纽黑文规定，肥皂分配器和厕纸盒在彻底的清洗过程中并不需要按照常规丢弃。

打扫空气/液体流动传染的病房规定环境服务人员需穿着正确的防护服和时刻佩戴N-95/HEPA防毒面罩。标准的外科面罩对于清洁液体流动传播传染的病人病房是足够的。

手术室

根据肯塔基大学医院关于手术室卫生要求的规定，卫生实践应该着眼于为围手术期的病人提供干净的环境和尽量降低污染废物对病人和手术团队的危险。巡回护士的职责是保持手术室在手术过程中的整洁，这包括用医用等级的杀菌剂立即清理血液或者其他体液的污染物，维持一块无菌区域，保持地面干净和为废弃物提供合适的托盘。其他手术室的卫生职责包括确保锋利废物盛放于正确的容器中；将器械移放至器械车上的合适区域；将污染液体吸入密闭的吸入系统；移除所有使用过的帷帘和织物并分开盛放于红色废物袋和棕色废物袋中。

环境服务人员应该使用医院等级的杀菌剂来清理手术室的家具，确保将手术床解锁并且移除床垫，这样整个区域都可以被清洁，这包括接缝处，桌子附件和病人移位器。所有的器械台的表面需要使用消毒剂擦洗，特别是有可视污物的区域。对于电外科设备和包含视频台车和升温设备，还有手术灯等特殊仪器，需要使用灭菌剂进行立即灭菌。其他的组织需使用刷子从地面上移除，然后使用湿真空吸尘器在临近被污染操作区域清洁。墙体可以被立即清洁，手术床被清洗后就可以在上面铺放干净的织物了。

根据肯塔基大学的规定，对手术室的彻底消毒使用机械摩擦和医院等级的消毒剂每周清洁一次。必须清洁的区域包括墙面，天花板，手术灯及灯臂，器械台，梅奥架，准备台，织物盒，顶部和框架，吸引器固定器，垃圾桶，踢水桶，整个地面，通气口的面板，病历夹车的表面和整个手术床。

在手术室周围的区域，走廊和刷手区需要被环境服务人员每天清洁和按需求随时清洁。地面每天清洁，一周擦洗一次。杂物间，推车房和器械室需要每天清洁和按需求随时清洁，这是夜班环境服务人员或者是保洁人员的责任。贮藏室，休息室/更衣室和洗澡间应该每天清洁和按需要随时清洁。每日最终的清洁应该是擦拭台阶边缘，移动器械至一边，以及使用湿真空吸尘器清理整个底面包括边角。